Efectele secundare sunt diferite in functie de zona anatomica care este tratata. De exemplu, exista efecte secundare mai importante daca se iradiaza o tumora in pelvis fata de situatia in care se iradiaza o tumora mamara.
In timpul radioterapiei, prin afectarea organelor si tesuturilor sanatoase aflate in vecinatatea tumorii, apar efecte nedorite. Acestea se mai numesc si secundare. Aparitia si intensitatea lor depind de doza totala si de zona iradiata. Unele organe sunt mai sensibile la iradiere fata de altele.
In cazul radioterapiei, sunt afectate doar tesuturile sanatoase aflate in zona tratata (numita volum tinta al radioterapiei). Spre deosebire de tratamentele care utilizeaza medicamente, cum este chimioterapia, care afecteaza intregul organism.