Este o etapa laborioasa, consumatoare de timp. Se va alege varianta optima de tratament, care va fi aprobata de catre medicul radioterapeut.
La finalul acestei etape, toate informatiile legate de administrarea practica a iradierii vor fi gata pentru a fi transferate catre echipamentul de iradiere (acceleratorul liniar).
Inainte ca pacientul sa fie tratat, trebuie verificata solutia de tratament oferita de software-ul computerizat. Se va iradia initial, conform planului, o „fantoma” (un dispozitiv cu detectori pentru radiatie ionizanta care se va plasa, in locul pacientului, pe masa acceleratorului) si cu ajutorul unui program special se va compara ce s-a calculat cu ce s-a masurat direct in sala de tratament. Dupa aceasta verificare, daca nu se gasesc erori, pacientul va putea incepe tratamentul.